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@ -277,7 +277,7 @@ Dans <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/catalog/ide" target="_blank">Ca
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- Attribué un nom personnalisé au service, une fois le service lancé ou enregistré, celui-ci apparaitra dans l’onglet <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/my-services" target="_blank">Mes services</a>.
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- Le choix de la version du service.
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- Sauvegarder l’entièreté de la configuration du service, que vous pourrez redéployer à volonté dans l’onglet <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/my-services" target="_blank">Mes services</a>.
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- Une extension est cliquable en bas à droite de la page, en parallèle de “Configuration %nom_du_service%”, cela déroulera un menu supplémentaire où vous pourrez configurer beaucoup plus de paramètre qui sont expliqué dans la section suivante <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/docs/index.md#configuration-g%C3%A9n%C3%A9ral-du-catalogue-de-services" target="_blank">disponible ici</a>.
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- Une extension est cliquable en bas à droite de la page, en parallèle de “Configuration %nom_du_service%”, cela déroulera un menu supplémentaire où vous pourrez configurer beaucoup plus de paramètre qui sont expliqué dans la section suivante <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#configuration-general-du-catalogue-de-services" target="_blank">disponible ici</a>.
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- Copier l’URL de lancement automatique, cela vous permettra de configurer un service, puis d’obtenir une URL que vous pourrez partager avec des collaborateurs. En cliquant sur cette URL, cela déploiera le service que vous avez configurer dans leurs espace onyxia. Cette option est aussi accessible dans l’onglet <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/my-services" target="_blank">Mes services</a>, sur vos services déjà enregistrés.
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Par ailleurs, l’option de la copie URL de lancement automatique ne s’affiche pas avant que vous ayez modifié un paramètre sur le service. L’option “Enregistrer la configuration” s’élargit également lors d’une quelconque modification, sinon c’est une petite icône de sauvegarde situé en haut à droite.
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@ -330,7 +330,7 @@ Ajouter un lien vers un script shell (enchaînement de commandes linux) qui est
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Ce lien du script doit être accessible sur internet, par exemple sur <https://code.groupe-genes.fr/> ou autres Git avec un projet public.
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<a href="https://git.drees.fr/drees_code_public/ressources/tutos/-/blob/diffusion/contenu/init.sh">Exemple de script d'initialisation</a>qui clone un projet à partir d'une instance Gitlab privée, configure les options globales de RStudio, ouvre automatiquement le projet RStudio cloné, installe et sélectionne la correction orthographique française, personnalise les bribes de codes (snippets).
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<a href="https://git.drees.fr/drees_code_public/ressources/tutos/-/blob/diffusion/contenu/init.sh">Exemple de script d'initialisation</a> qui clone un projet à partir d'une instance Gitlab privée, configure les options globales de RStudio, ouvre automatiquement le projet RStudio cloné, installe et sélectionne la correction orthographique française, personnalise les bribes de codes (snippets).
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!!! warning
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Le script est exécuté en tant que superutilisateur (*Root*) et les fichiers qu'il crée sont ainsi la propriété du superutilisateur.
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@ -26,13 +26,15 @@ Dans le cadre de projets collaboratifs :
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Bien qu'une utilisation hors-ligne de Git soit possible, tout l'intérêt du contrôle de version réside dans la synchronisation de la copie locale d'un projet (_clone_) avec un dépôt distant (_remote_). Différents services de forge logicielle permettent cette synchronisation des projets Git, dont les plus connus sont <a href="https://github.com" target="_blank">Github</a> et <a href="https://about.gitlab.com" target="_blank">GitLab</a>. Dans la mesure où le premier dispose aujourd'hui de beaucoup plus de visibilité — par exemple, les dépôts du Genes, sont hébergé en interne via Gitea <a href="https://code.groupe-genes.fr/" target="_blank">accessible ici</a>.
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Vous disposer donc automatiquement d'un dépôt <a href="https://code.groupe-genes.fr/" target="_blank">GitGenes</a>, que vous pouvez accéder en utilisant votre compte ENSAE. Celui-ci est également automatiquement intégré sur votre compte du datalab comme <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/pole-scientifique/Onyxia/docs/#services-externes" target="_blank">décrit ici</a>.
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Vous disposer donc automatiquement d'un dépôt <a href="https://code.groupe-genes.fr/" target="_blank">GitGenes</a>, que vous pouvez accéder en utilisant votre compte ENSAE. Celui-ci est également automatiquement intégré sur votre compte du datalab comme <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#services-externes" target="_blank">décrit ici</a>.
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le Datalab propose une intégration facilitée avec Git, que nous vous présentons à travers ce tutoriel. La suite du guide vous permettra de configurer GitHub & GitGenes sur le datalab à deux endroits:
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- Dans l'onglet <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/account/third-party-integration" target="_blank">Services externes</a> qui ajoutera la configuration de votre dépôt git automatiquement sur chaques service qui vous créé (plus d'information sur notre <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/pole-scientifique/Onyxia/docs/#services-externes" target="_blank">guide principal ici</a> )
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- Dans l'onglet <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/account/third-party-integration" target="_blank">Services externes</a> qui ajoutera la configuration de votre dépôt git automatiquement sur chaques service qui vous créé (plus d'information sur notre <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#services-externes" target="_blank">guide principal ici</a> )
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- Lors de la création d'un <a href="https://onyxia.lab.groupe-genes.fr/my-services" target="_blank">Services</a>
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https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#configuration-general-du-catalogue-de-services
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Le guide montre en détail comment récupérer les informations suivantes sur Github & GitGenes:
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- Nom d'utilisateur pour Git
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- Email pour Git
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@ -131,13 +133,13 @@ Nous avons vu précédemment les différentes informations nécessaires pour la
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#### Nom d'utilisateur, email & jeton d'accès (token)
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Ces informations peuvent être ajoutées à deux endroits différents:
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- Sur l'onglet "Mon compte" qui va permettre d'ajouter un Git qui sera ensuite configuré par défaut sur chaque nouveau service que vous créerez, <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/pole-scientifique/Onyxia/docs/#services-externes" target="_blank">plus d'information ici</a>.
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- Individuellement sur chaques services que vous créerez dans le sous onglet "Git" lors de la configuration du service, <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/pole-scientifique/Onyxia/docs/#git" target="_blank">plus d'information ici</a>.
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- Sur l'onglet "Mon compte" qui va permettre d'ajouter un Git qui sera ensuite configuré par défaut sur chaque nouveau service que vous créerez, <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#services-externes" target="_blank">plus d'information ici</a>.
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- Individuellement sur chaques services que vous créerez dans le sous onglet "Git" lors de la configuration du service, <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#git" target="_blank">plus d'information ici</a>.
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#### Ajout de l'URL de dépôt
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Pour que vos dépôt soit ajouter sur vos services, il faudra le spécifié l'URL de dépôt à chaque création d'un nouveau service L'URL de dépôt <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/pole-scientifique/Onyxia/docs/#git" target="_blank">détaillé ici</a>, penser donc à enregistrer la configuration de vos services afin de facilité la création récurente de vos services, plus de détails sur comment enregistrer et configurer un <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/pole-scientifique/Onyxia/docs/#configuration-general-du-catalogue-de-services" target="_blank">service ici</a>.
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Pour que vos dépôt soit ajouter sur vos services, il faudra le spécifié l'URL de dépôt à chaque création d'un nouveau service L'URL de dépôt <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#git" target="_blank">détaillé ici</a>, penser donc à enregistrer la configuration de vos services afin de facilité la création récurente de vos services, plus de détails sur comment enregistrer et configurer un <a href="https://documentation-dsit.lab.groupe-genes.fr/Services/Datalab/Onyxia/#configuration-general-du-catalogue-de-services" target="_blank">service ici</a>.
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### Git via le terminal
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